Genetic Polymorphisms of SPRY4 are Associated with Adolescent Idiopathic Scoliosis in Chinese Han Population: A Single Center Retrospective Study
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摘要:目的 探究SPRY4基因多态性与中国汉族人群青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)及PUMC分型的相关性,以期为该病的病因学研究提供思路。方法 回顾性收集2017年12月—2021年12月北京协和医院诊治的中国北方地区汉族AIS患者及按年龄、性别与其进行1∶1匹配的健康受试者临床资料。比较二者SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点等位基因频率及基因型分布差异,并分析上述位点基因型与AIS患者PUMC分型的关联性。结果 共入选符合纳入与排除标准的AIS患者97例,健康受试者100名。AIS患者rs10040443位点等位基因C[17.5%(34/194)比8.0%(16/200),P=0.005]及CC基因型频率[10.3%(10/97)比1.0%(1/100),P=0.0014]均高于健康受试者,rs3797053位点等位基因频率及基因型分布与健康受试者均无显著差异(P均>0.05)。多因素Logistic回归分析校正性别的影响后,rs10040443位点多态性在共显性、隐性及加性遗传模式下与AIS均存在关联性,其CC基因型可增加AIS发生风险;在各种遗传模式下,rs3797053位点多态性与AIS均无明显关联性。AIS患者SPRY4基因rs10040443位点基因型分布与PUMC分型具有一定关联性,CT+TT基因型患者中PUMC Ⅱ型的比例显著高于CC基因型患者(66.67% 比0,P<0.001);rs3797053位点基因型分布与PUMC分型无明显关联性(P=0.315)。结论 中国北方地区汉族人群SPRY4基因rs10040443位点多态性与AIS相关,该位点CC基因型可能是AIS的危险因素,CT+TT基因型与PUMC Ⅱ型具有一定关联。
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关键词:
- 基因多态性 /
- 青少年特发性脊柱侧凸 /
- PUMC分型 /
- SPRY4基因
Abstract:Objective To explore the correlation between SPRY4 gene polymorphism and typing of adolescent idiopathic scoliosis (AIS) and PUMC in Han Chinese, in order to provide insights for etiological research of the disease.Methods Clinical data were retrospectively collected from Han nationality patients with AIS in northern China treated at Peking Union Medical College Hospital from December 2017 to December 2021, and healthy subjects were matched 1∶1 with them by age and sex. The allele frequency and genotype distribution of rs3797053 and rs10040443 of SPRY4 gene were compared, and the association between the above loci genotypes and PUMC typing of AIS patients was analyzed.Results A total of 97 patients with AIS and 100 healthy subjects who met inclusion and exclusion criteria were included in this study. The rs10040443 allele C[17.5%(34/194) vs. 8.0%(16/200), P=0.005] and the distribution frequency of CC genotype [10.3%(10/97) vs. 1.0%(1/100), P=0.0014] in AIS patients were higher than those in healthy subjects. There was no significant difference in allele frequency and genotype distribution of rs3797053 between AIS patients and healthy subjects (all P > 0.05). After adjusting for gender, multiple Logistic regression analysis showed that rs10040443 polymorphism was associated with AIS in codominant, recessive and additive genetic modes, and CC genotype could increase the risk of AIS. There was no significant association between rs3797053 polymorphism and AIS in all genetic models. The genotype distribution of rs10040443 of SPRY4 gene in AIS patients was associated with PUMC typing. The proportion of PUMC Ⅱ in CT+TT genotype patients was significantly higher than that in CC genotype patients (66.67% vs. 0, P < 0.001). Rs3797053 genotype distribution was not significantly associated with PUMC genotype distribution (P=0.315).Conclusions The polymorphism of rs10040443 of SPRY4 gene is associated with AIS in northern Chinese Han population. CC genotype of this locus may be a risk factor for AIS, and CT+TT genotype is associated with PUMCⅡ type.-
Keywords:
- gene polymorphism /
- adolescent idiopathic scoliosis /
- PUMC type /
- SPRY4 gene
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青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)是一种以脊柱三维畸形为主要特征的骨科疾病,多发生于10~18岁青少年,其约占所有脊柱侧凸的90%,影响1%~3%青少年的身心健康[1-2]。该病具有一定的遗传倾向性,但具体病因未明,且存在明显的Carter效应,女性发生率约为男性的2~10倍,可能与多基因遗传模式相关,男性需更大的遗传负荷才会发病[3]。
SPRY4基因属于可编码富含半胱氨酸和脯氨酸蛋白质家族的成员之一,具有调控生长发育的作用。本团队前期研究发现,AIS患者骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cells, MSCs)中SPRY4水平显著下调,敲低SPRY4或SPRY4表达缺失可损害MSCs向成骨细胞分化,导致骨骼发育异常,可能为AIS的诱发因素[4]。此外,本研究团队在AIS患者MSCs中发现54个既往未被识别的差异性表达的微RNA(microRNA,miRNA),其可通过多种信号通路调控MSCs分化[5]。由于SPRY4基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)亦可影响MSCs分化,推测其可能通过与miRNA相结合,进而发挥影响MSCs分化、促进AIS发病的效应。miRNA主要与3′非编码区(3′untranslated region, 3′UTR)结合[6],此区域不仅可在调节mRNA定位方面发挥重要作用[7],同时是调控mRNA稳定性、正确时空翻译的重要结构[8],有助于揭示人类疾病和进化的因果关系[9]。本研究针对3′UTR区域位点,首次探究了中国汉族人群SPRY4基因多态性与AIS的相关性,以期为AIS病因学研究提供新的证据。
1. 资料与方法
1.1 研究对象
本研究为回顾性分析,研究对象为2017年12月—2021年12月北京协和医院AIS患者及健康受试者。AIS患者纳入标准:(1)依据临床表现及正侧位X线片确诊为AIS且Cobb角>20°;(2)发病年龄为10~18岁;(3)中国北方地区(黄河以北的区域,如河北省、山东省、山西省、北京市和天津市等)汉族人群。排除标准:(1)合并其他原因导致的脊柱畸形;(2)影像学资料不完整;(3)合并影响骨骼发育的慢性疾病。
健康受试者纳入标准:(1)体检健康,无研究相关疾病;(2)中国北方地区汉族人群;(3)按照年龄、性别与AIS患者进行1∶1匹配。排除标准:(1)全脊柱X线片、MRI等影像学资料不完整者;(2)合并影响骨骼发育的慢性疾病。
本研究已通过北京协和医院伦理审查委员会审批(审批号:JS-3403),并豁免患者知情同意。
1.2 研究方法
收集AIS患者的AIS分型及AIS患者与健康受试者年龄/性别信息、SPRY4基因测序结果。AIS主流的手术分型包括King分型、Lenke分型及PUMC分型,其中以PUMC分型的可信度和可重复性最佳,且适合脊柱三维矫形,其将AIS分为Ⅰ型(单弯)、Ⅱ型(双弯)和Ⅲ型(三弯)[10]。本研究根据全脊柱X线片,记录AIS患者的PUMC分型。
SPRY4基因检测方法:(1)样本收集:采集空腹外周静脉血2 mL置于EDTA抗凝管中,-80 ℃保存备用。(2)基因组提取及测序:采用酚-氯仿抽提法提取全基因组DNA,并溶于TE缓冲液。基因组DNA经Nano Drop分光光度计测定纯度和浓度后,采用全基因组测序方法对SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点SNP进行分型检测,记录各位点等位基因频率、基因型、遗传模式等,所有测序工作均由深圳华大基因科技有限公司完成。
1.3 样本量估算
本研究为病例对照研究,以C等位基因频率作为主要观测指标进行样本量估算。检索国家生物技术信息中心数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/?term=) 后发现,AIS患者rs10040443位点等位基因C的频率为8.4%,而健康人群仅为5%,在检验水准a=0.05,把握度为90%,样本比例为1∶1的情况下,经计算两组所需最低样本均为97例。
1.4 统计学处理
采用SPSS 25.0软件进行统计学分析。等位基因频率、基因型、PUMC分型等计数资料以频数(百分数)表示,组间比较采用卡方检验或Fisher精确概率法。采用卡方检验进行Hardy Weinberg遗传平衡检验。采用多因素Logistic回归法分析SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点SNP与AIS的关联性。以P<0.05为差异具有统计学意义。
2. 结果
2.1 一般临床资料
共入选符合纳入与排除标准的AIS患者97例,健康受试者100名。健康受试者中,男性15例,女性85例;平均年龄(14.48±1.13)岁;SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点均符合Hardy Weinberg遗传平衡定律(P均>0.05),提示各位点基因分布处于平衡状态,样本具有代表性。AIS患者中,男性13例,女性84例;平均年龄(14.45±1.11)岁;rs10040443基因型频率分布偏离Hardy Weinberg遗传平衡定律,提示与疾病易感性存在关联。
2.2 SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点基因型及等位基因分布与AIS的关联性
AIS患者rs10040443位点等位基因C及CC基因型频率均高于健康受试者(P均<0.05),rs3797053位点等位基因频率及基因型分布与健康受试者均无显著差异(P均>0.05),见表 1。
表 1 AIS患者与健康受试者SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点基因型及等位基因分布比较[n(%)]组别 rs3797053 rs3797053 rs10040443 rs10040443 A G AA GA GG C T CC CT TT 健康受试者(n=100) 126(63.0) 74(37.0) 40(40.0) 46(46.0) 14(14.0) 16(8.0) 184(92.0) 1(1.0) 14(14.0) 85(85.0) AIS患者(n=97) 133(68.5) 61(31.5) 45(46.3) 43(44.3) 9(9.4) 34(17.5) 160(82.5) 10(10.3) 14(14.4) 73(75.3) P值 0.245 0.499 0.005 0.014 AIS:青少年特发性脊柱侧凸 进一步采用多因素Logistic回归分析校正性别因素后发现,在各种遗传模式下,rs3797053位点多态性与AIS均无明显关联性(表 2);在共显性、隐性及加性遗传模式下,rs10040443位点多态性与AIS存在关联性,其CC基因型可增加AIS发生风险(表 3)。
表 2 校正性别因素后,SPRY4基因rs3797053位点与AIS的关联性分析[n(%)]遗传模式 健康受试者(n=100) AIS患者(n=97) OR(95% CI) P值 共显性 0.460 AA 40(40.0) 45(46.4) 1 GA 46(46.0) 43(44.3) 0.83(0.46~1.51) GG 14(14.0) 9(9.3) 0.57(0.22~1.46) 显性 0.340 AA 40(40.0) 45(46.4) 1 GA+GG 60(60.0) 52(53.6) 0.77(0.44~1.36) 隐性 0.280 AA+GA 86(86.0) 88(90.7) 1 GG 14(14.0) 9(9.3) 0.63(0.26~1.53) 超显性 0.800 AA+GG 54(54.0) 54(55.7) 1 GA 46(46.0) 43(44.3) 0.93(0.53~1.64) 加性 0.78(0.51~1.19) 0.230 AIS:同表 1 表 3 校正性别因素后,SPRY4基因rs10040443位点与AIS的关联性分析[n(%)]遗传模式 健康受试者(n=100) AIS患者(n=97) OR(95% CI) P值 共显性 0.010 TT 85(85.0) 73(75.3) 1 CT 14(14.0) 14(14.4) 1.16(0.52~2.60) CC 1(1.0) 10(10.3) 11.64(1.46~93.10) 显性 0.093 TT 85(85.0) 73(75.3) 1 CT+CC 15(15.0) 24(24.7) 1.86(0.91~3.82) 隐性 0.0026 TT+CT 99(99.0) 87(89.7) 1 CC 1(1.0) 10(10.3) 11.38(1.43~90.66) 超显性 0.950 TT+CC 86(86.0) 83(85.6) 1 CT 14(14.0) 14(14.4) 1.04(0.47~2.31) 加性 1.96(1.12~3.43) 0.015 AIS: 同表 1 2.3 AIS患者SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点基因型与性别及PUMC分型的关联性
AIS患者中,SPRY4基因rs3797053位点基因型分布与性别、PUMC分型均无明显关联性(P均>0.05);rs10040443位点基因型分布与性别亦无明显相关(P>0.999),但与PUMC分型具有一定关联性(P<0.001),CT+TT基因型患者中PUMC Ⅱ型的比例显著高于CC基因型患者(66.67% 比0,P<0.001),见表 4。
表 4 不同性别、PUMC分型AIS患者SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点基因型分布比较[n(%)]基因位点 性别 PUMC分型 男性 女性 Ⅰ型 Ⅱ型 Ⅲ型 rs3797053 AA 6(6.2) 39(40.2) 17(17.5) 24(24.8) 4(4.1) GA 6(6.2) 37(38.1) 9(9.3) 27(27.8) 7(7.2) GG 1(1.0) 8(8.2) 2(2.1) 7(7.2) 0(0) P值* >0.999 0.315 rs10040443 CC 1(1.0) 9(9.3) 6(6.2) 0(0) 4(4.1) CT 2(2.1) 12(12.4) 7(7.2) 5(5.2) 2(2.1) TT 10(10.3) 63(64.9) 15(15.4) 53(54.6) 5(5.2) P值* >0.999 <0.001 *采用Fisher精确概率法;AIS:同表 1 3. 讨论
本研究基于病例对照设计,首次探究了中国北方汉族人群SPRY4基因多态性与AIS的相关性,结果发现AIS患者SPRY4基因rs10040443位点等位基因C及CC基因型频率均较健康受试者升高;校正性别因素后,rs10040443位点在共显性、隐性及加性遗传模式下均与AIS具有关联性,该位点CC基因型与AIS发生风险增加有关。在SPRY4基因多态性与性别、AIS临床表型相关性的分析中发现,rs10040443位点基因型与PUMC分型亦存在一定关联性,提示SPRY4基因rs10040443位点可能参与了AIS发病,为该病的病因学研究提供了新思路。
SPRY可通过特异性抑制成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor, FGF)受体、表皮生长因子(epidermal growth factor, EGF)受体和血管内皮生长因子(vascular endothlial growth factor, VEGF)受体活性,在人类胚胎干细胞增殖与存活的调控中发挥重要作用。目前已知的SPRY家族由SPRY1、SPRY2、SPRY3及SPRY4组成[11-13],其中SPRY1和SPRY2编码蛋白是晶状体囊泡分离和角膜分化的必需物质,SPRY3参与丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)通路的负性调控[14]。SPRY4基因位于5q31.3,由5个外显子组成,其编码蛋白为受体转导的MAPK信号通路抑制剂,并可破坏活性单体GTP结合蛋白(GTP-rat sarcoma, GTP-RAS)的形成。研究显示,SPRY4是人类胚胎干细胞中表达最高的两个Sprouty家族成员之一[15-18]。在不同类型细胞中,SPRY4调控生长因子信号的应答效应存在差异[19]。Li等[20]研究发现,SPRY4在体内与体外对人脂肪源性间充质干细胞(human adipose tissue derived mesenchymal stem cells, hAMSCs)的脂肪形成均有促进作用。与之不同,沉默C57BL/6小鼠骨髓中SPRY4表达可阻断脂肪堆积,该现象或可解释AIS患者体脂率普遍较低的原因[21]。由于肌肉和脂肪含量增加分别可将脊柱侧凸发生风险降低20%和13%[22],而SPRY4蛋白可调控脂肪形成,故推测其与AIS具有一定相关性。此外,成骨细胞和软骨细胞分化功能障碍可能是AIS的促进因素,敲低健康人群软骨细胞中SPRY4基因可引起软骨细胞肥大、衰老、活性降低,并促进活性氧和细胞外基质表达,进而导致脊柱两侧软骨生长板生长速度不一致,诱发AIS[23]。
既往文献已证实,3′UTR区域可与miRNA相结合发挥骨骼生长发育调控作用。如Song等[24]研究发现,rs4148941位点(A等位基因)转录物与miR-513a-5p的相互作用可能与腰椎间盘退变具有一定关联性。FGF2的3′UTR区域中存在与中国人群骨矿物质密度相关的位点,且其功能受miR-196a-3p的调节[25]。检索文献未发现SPRY4基因多态性与AIS关联性的相关研究。本研究以rs3797053与rs10040443位点为切入点,首次在中国汉族人群中探究了SPRY4基因多态性与AIS的关联性。此两个位点均位于3′UTR区域,且次要等位基因频率均大于5%。单因素分析显示,rs3797053位点等位基因频率及基因型分布在AIS患者与健康受试者之间无显著差异,AIS患者rs10040443位点等位基因C及CC基因型频率高于健康受试者,提示rs10040443位点可能与AIS发病具有相关性;校正混杂因素后此种相关性仍存在,认为rs10040443位点CC基因型可能增加AIS发生风险。
准确的AIS分型是制订临床治疗决策的前提和基础。AIS主要包括三大分型系统,即King分型、Lenke分型及PUMC分型,其中PUMC分型更适合指导AIS患者进行三维矫形[26]。本研究发现AIS患者SPRY4基因rs10040443位点CC+TT基因型与PUMC Ⅱ型具有一定关联性,CC+TT基因型的AIS患者更可能表现为PUMC Ⅱ型。由于AIS由多个基因调控且受多个环节、多种因素的影响,这可能从理论层面解释了AIS患者存在不同程度畸形的原因。
本研究局限性:(1)虽然初步认为SPRY4基因rs10040443位点多态性与AIS具有相关性,但目前尚缺乏足够的分子机制研究证据,二者是否具有因果关系尚需进一步验证。(2)AIS患儿在10~18岁期间,其脊柱畸形分型呈现为动态演变的状态,本研究PUMC分型仅为其中一个时间点的静态影像结果,以致研究结果可能存在偏倚。(3)本文研究对象均为中国北方汉族人群,结果外推需谨慎。
综上所述,SPRY4基因rs10040443位点多态性可能与中国北方地区汉族人群AIS具有相关性,该位点CC基因型可能为AIS的危险因素。此外,CT+TT基因型与PUMC Ⅱ型亦具有一定相关性,若AIS患者基因检测结果为CT+TT基因型,则其后期进展为PUMC Ⅱ型的风险增加,该基因位点有望成为预测AIS进展情况的参考指标,并辅助临床进行早期干预。本研究结果有助于明确SPRY4基因多态性与中国汉族人群AIS易感性的关系,为该病的病因学研究提供了新思路,并为临床干预提供了依据。
作者贡献:吴增玉负责研究设计、数据收集与整理、统计分析、论文撰写;张跃川负责文献检索;彭越负责伦理材料收集;吴南负责测序数据及伦理材料收集;邱贵兴、庄乾宇、仉建国负责研究设计、研究指导、论文修订。利益冲突:所有作者均声明不存在利益冲突 -
表 1 AIS患者与健康受试者SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点基因型及等位基因分布比较[n(%)]
组别 rs3797053 rs3797053 rs10040443 rs10040443 A G AA GA GG C T CC CT TT 健康受试者(n=100) 126(63.0) 74(37.0) 40(40.0) 46(46.0) 14(14.0) 16(8.0) 184(92.0) 1(1.0) 14(14.0) 85(85.0) AIS患者(n=97) 133(68.5) 61(31.5) 45(46.3) 43(44.3) 9(9.4) 34(17.5) 160(82.5) 10(10.3) 14(14.4) 73(75.3) P值 0.245 0.499 0.005 0.014 AIS:青少年特发性脊柱侧凸 表 2 校正性别因素后,SPRY4基因rs3797053位点与AIS的关联性分析[n(%)]
遗传模式 健康受试者(n=100) AIS患者(n=97) OR(95% CI) P值 共显性 0.460 AA 40(40.0) 45(46.4) 1 GA 46(46.0) 43(44.3) 0.83(0.46~1.51) GG 14(14.0) 9(9.3) 0.57(0.22~1.46) 显性 0.340 AA 40(40.0) 45(46.4) 1 GA+GG 60(60.0) 52(53.6) 0.77(0.44~1.36) 隐性 0.280 AA+GA 86(86.0) 88(90.7) 1 GG 14(14.0) 9(9.3) 0.63(0.26~1.53) 超显性 0.800 AA+GG 54(54.0) 54(55.7) 1 GA 46(46.0) 43(44.3) 0.93(0.53~1.64) 加性 0.78(0.51~1.19) 0.230 AIS:同表 1 表 3 校正性别因素后,SPRY4基因rs10040443位点与AIS的关联性分析[n(%)]
遗传模式 健康受试者(n=100) AIS患者(n=97) OR(95% CI) P值 共显性 0.010 TT 85(85.0) 73(75.3) 1 CT 14(14.0) 14(14.4) 1.16(0.52~2.60) CC 1(1.0) 10(10.3) 11.64(1.46~93.10) 显性 0.093 TT 85(85.0) 73(75.3) 1 CT+CC 15(15.0) 24(24.7) 1.86(0.91~3.82) 隐性 0.0026 TT+CT 99(99.0) 87(89.7) 1 CC 1(1.0) 10(10.3) 11.38(1.43~90.66) 超显性 0.950 TT+CC 86(86.0) 83(85.6) 1 CT 14(14.0) 14(14.4) 1.04(0.47~2.31) 加性 1.96(1.12~3.43) 0.015 AIS: 同表 1 表 4 不同性别、PUMC分型AIS患者SPRY4基因rs3797053、rs10040443位点基因型分布比较[n(%)]
基因位点 性别 PUMC分型 男性 女性 Ⅰ型 Ⅱ型 Ⅲ型 rs3797053 AA 6(6.2) 39(40.2) 17(17.5) 24(24.8) 4(4.1) GA 6(6.2) 37(38.1) 9(9.3) 27(27.8) 7(7.2) GG 1(1.0) 8(8.2) 2(2.1) 7(7.2) 0(0) P值* >0.999 0.315 rs10040443 CC 1(1.0) 9(9.3) 6(6.2) 0(0) 4(4.1) CT 2(2.1) 12(12.4) 7(7.2) 5(5.2) 2(2.1) TT 10(10.3) 63(64.9) 15(15.4) 53(54.6) 5(5.2) P值* >0.999 <0.001 *采用Fisher精确概率法;AIS:同表 1 -
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